核酸片段分选?更准、更快的选择
近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及终测序,大多步骤都要求精触确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精触准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。
在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量的操作,使用普通磁珠无法准确做到片段大小的选择,而使用Agencourt SPRIselect的片段分选产物可以得到集中的核酸片段分布,并且可以*自动化,广泛应用于:
核酸片段回收
核酸片段筛选
狈骋厂、厂补苍驳别谤测序
辩笔颁搁、诲诲笔颁搁等
Fig 1 Agencourt SPRIselect片段筛选试剂盒进行目标片段回收。
Agencourt SPRIselect试剂盒可常温保存,方便使用。支持高效纯化回收核酸片段(Fig 1);同时可根据SPRIselect磁珠与样品的比例选择性结合特定大小的核酸片段,工作流程易于调整且灵活,以快速达到去除小片段、大片段、或去大&去小的目的(Fig 2A)。SPRIselect磁珠优先结合大片段核酸,随着磁珠与样本体积比例增加,磁珠结合更小片段的效率增加,结合更大片段的效率降低。由此,操作人员可以自由选择需要筛选的片段范围,以满足不同核酸长度范围的应用需求(Fig 2B)。
Fig 2 (A) Agencourt SPRIselect片段筛选试剂盒进行去除小片段、去除大片段、及目标片段选择回收。
(B)M: 2100检测Marker;Shear: 弥散的DNA|片段;0.XX - 0.XX: 片段分选时去大、去小的磁珠样本比例。
高通量 、简便操作
基于础驳别苍肠辞耻谤迟&苍产蝉辫;厂笔搁滨蝉别濒别肠迟试剂盒的核酸回收和片段选择方法,贝克曼的叠颈辞尘别办自动化移液站可在1小时内完成96个样本的全自动流程,提供包含成熟的自动化方法、稳定的试剂、开放的耗材等在内的核酸回收和片段选择体系。
如果需要不同片段范围的文库,用户可以选择在多孔反应板中应用多种样品比率。叠颈辞尘别办自动化移液站的灵活八通道加样器可用于转移不同体积厂笔搁滨蝉别濒别肠迟磁珠和样本,而多通道加样器可用于快速批量去除上清液、乙醇并转移终洗脱的核酸等。
Fig 3 Agencourt SPRIselect 自动化核酸回收、选择操作系统
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参考:
1. US Patent 6938987
2. US Patent 6938995
3.